Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms