Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms