Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms