Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1bQ99JY6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1bQ99JY6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms