Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Letmd1Q924L1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Letmd1Q924L1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Letmd1Q924L1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Letmd1Q924L1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Letmd1Q924L1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms