Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms