Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Odf3Q920N1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Odf3Q920N1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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