Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms