Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdhga12Q91XY7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdhga12Q91XY7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms