Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Creb3l3Q91XE9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Creb3l3Q91XE9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms