Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms