Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc3Q91W40 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms