Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx9Q91VH2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx9Q91VH2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms