Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms