Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms