Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc115Q8VE99 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms