Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms