Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM1

Zgpat, Zinc finger CCCH-type with G patch domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZgpatQ8VDM1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZgpatQ8VDM1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZgpatQ8VDM1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZgpatQ8VDM1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZgpatQ8VDM1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZgpatQ8VDM1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZgpatQ8VDM1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZgpatQ8VDM1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZgpatQ8VDM1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms