Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tspan10Q8VCF5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan10Q8VCF5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan10Q8VCF5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan10Q8VCF5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tspan10Q8VCF5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tspan10Q8VCF5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tspan10Q8VCF5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tspan10Q8VCF5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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