Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cops8Q8VBV7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops8Q8VBV7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops8Q8VBV7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms