Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms