Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms