Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrtm1Q8K377 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms