Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsl1Q8K305 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms