Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms