Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pacs1Q8K212 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacs1Q8K212 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms