Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms