Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh3Q8K1E6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms