Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfm1Q8K0D5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms