Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l2Q8JZQ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l2Q8JZQ2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms