Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Znf628Q8CJ78 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf628Q8CJ78 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf628Q8CJ78 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Znf628Q8CJ78 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms