Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rfwd3Q8CIK8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms