Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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