Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms