Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph6aQ8CDR2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms