Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RybpQ8CCI5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms