Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn5Q8CBA2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms