Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
4930507D05RikQ8C9C9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms