Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stbd1Q8C7E7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms