Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssuh2Q8C3L1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssuh2Q8C3L1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms