Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo3Q8C2S7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Amigo3Q8C2S7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms