Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne1Q8C166 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne1Q8C166 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms