Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms