Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccser1Q8C0C4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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