Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms