Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms