Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad3Q8BUN5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad3Q8BUN5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms