Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT42

Smim5, Small integral membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim5Q8BT42 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smim5Q8BT42 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim5Q8BT42 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms