Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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