Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3Q8BRE0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3Q8BRE0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms